怪人与邪兽再次出现在世上了，但是魔法少女迟迟没有出现。过去的经验告诉人们，怪人和邪兽就像是一种天灾一般，就算一度被消灭干净，但过个几年又会重新诞生。他们诞生机制未明，形态各异，唯一的共同点是，对人类文明有莫大的恶意，每次出现都会造成大量财产损失，乃至平民伤亡。而人类的科技再怎么进步，研究再怎么深入，都无法做出分毫的有效抵抗。好在凡是这种黑暗时刻，总有一群少女挺身而出。魔法少女，一群本该无忧无虑地在学校享受青春的小女孩，为了保护他人，赌上性命去与怪人邪兽生死搏杀，这个世界才没有堕入无尽黑暗之中。可是现在……